Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HES3Q5TGS1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
HES3Q5TGS1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
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