Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FRMPD1Q5SYB0 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms