Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms