Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms