Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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