Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMC1AQ14683 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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