Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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