Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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