Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SREBF2Q12772 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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