Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 LDLR-205ENST00000557933 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms