Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms