Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HBBP68871 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms