Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms