Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2BFSP57053 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms