Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms