Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5OP48047 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms