Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJC1P36383 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJC1P36383 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJC1P36383 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms