Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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HOXD10P28358 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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HOXD10P28358 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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HOXD10P28358 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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HOXD10P28358 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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HOXD10P28358 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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