Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2AP24928 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms