Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms