Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCP20941 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCP20941 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCP20941 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms