Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms