Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms