Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms