Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms