Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 467.9 ms