Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms