Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-204ENST00000359106 7648 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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