Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGIP1Q9BQI5 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms