Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRIM11Q96F44 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRIM11Q96F44 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRIM11Q96F44 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRIM11Q96F44 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRIM11Q96F44 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRIM11Q96F44 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRIM11Q96F44 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRIM11Q96F44 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRIM11Q96F44 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM11Q96F44 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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