Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HDAC11Q96DB2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms