Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TMIEQ8NEW7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TMIEQ8NEW7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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