Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C17orf47Q8NEP4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C17orf47Q8NEP4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C17orf47Q8NEP4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C17orf47Q8NEP4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C17orf47Q8NEP4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C17orf47Q8NEP4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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C17orf47Q8NEP4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C17orf47Q8NEP4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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