Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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LNX2Q8N448 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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LNX2Q8N448 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LNX2Q8N448 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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