Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms