Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms