Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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