Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATL3Q6DD88 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms