Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms