Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM69BQ5VUD6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms