Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms