Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS9

USP39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39Q53GS9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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