Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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