Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM187BQ17R55 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms