Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 MYO5B-201ENST00000285039 9505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms