Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TEX13D-201ENST00000632372 4203 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PPFIA2-214ENST00000549325 4727 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CPEB3-202ENST00000412050 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SLIT2-201ENST00000273739 5132 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CNTNAP3B-211ENST00000612828 7455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CPNE4-209ENST00000512055 5431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TBC1D16-202ENST00000340848 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 L1CAM-201ENST00000361699 3888 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ZNF549-201ENST00000240719 3969 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AL713866.1-201ENST00000563320 3125 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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