Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITSN1Q15811 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITSN1Q15811 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITSN1Q15811 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITSN1Q15811 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITSN1Q15811 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITSN1Q15811 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITSN1Q15811 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITSN1Q15811 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITSN1Q15811 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITSN1Q15811 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITSN1Q15811 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITSN1Q15811 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITSN1Q15811 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITSN1Q15811 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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