Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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PTPRKQ15262 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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PTPRKQ15262 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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