Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PDCD1Q15116 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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