Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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